Минфин считает, что при отсутствии трудового договора с единственным учредителем организации, выполняющим функции ее генерального директора, нет оснований для обложения ЕСН производимых в его пользу выплат

Такой вывод можно сделать из следующих фраз письма Минфина РФ от 03.11.2009 № 03-04-06-02/79:
В соответствии с п. 1 ст. 236 Кодекса объектом налогообложения ЕСН для налогоплательщиков-организаций признаются выплаты и иные вознаграждения, начисляемые ими в пользу физических лиц по трудовым и гражданско-правовым договорам, предметом которых является выполнение работ, оказание услуг (за исключением вознаграждений, выплачиваемых индивидуальным предпринимателям, адвокатам, нотариусам, занимающимся частной практикой), а также по авторским договорам.
В случае отсутствия вышеуказанных договоров, в том числе трудового договора между физическим лицом как руководителем организации и организацией в лице этого же физического лица как ее единственного учредителя, считаем, что на основании п. 1 ст. 236 Кодекса объект для исчисления ЕСН не возникает.

Министерство финансов РФ
письмо от 03.11.2009 № 03-04-06-02/79

Департамент налоговой и таможенно-тарифной политики рассмотрел письмо по вопросу налогообложения единым социальным налогом (далее - ЕСН) и обложению страховыми взносами на обязательное пенсионное страхование выплат в пользу руководителя - единственного учредителя юридического лица и в соответствии со ст. 34.2 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) разъясняет следующее.
В соответствии с п. 1 ст. 236 Кодекса объектом налогообложения ЕСН для налогоплательщиков-организаций признаются выплаты и иные вознаграждения, начисляемые ими в пользу физических лиц по трудовым и гражданско-правовым договорам, предметом которых является выполнение работ, оказание услуг (за исключением вознаграждений, выплачиваемых индивидуальным предпринимателям, адвокатам, нотариусам, занимающимся частной практикой), а также по авторским договорам.
В случае отсутствия вышеуказанных договоров, в том числе трудового договора между физическим лицом как руководителем организации и организацией в лице этого же физического лица как ее единственного учредителя, считаем, что на основании п. 1 ст. 236 Кодекса объект для исчисления ЕСН не возникает.
Поскольку согласно п. 2 ст. 10 Федерального закона от 15.12.2001 N 167-ФЗ "Об обязательном пенсионном страховании в Российской Федерации" объектом обложения страховыми взносами и базой для начисления страховых взносов являются объект налогообложения и налоговая база по ЕСН, установленные гл. 24 Кодекса, данная позиция распространяемся и на уплату страховых взносов на обязательное пенсионное страхование.
Вопрос возможности заключения трудового договора в вышеуказанном случае не относится к компетенции Минфина России.

Заместитель директора
Департамента налоговой
и таможенно-тарифной политики
С.В. РАЗГУЛИН